Специальный состав наносят на рабочую зону — область, в которой необходимо подавить микроорганизмы (пародонтальный карман, корневой канал или болезненный участок слизистой), и он избирательно пропитывает оболочку микроорганизмов, не затрагивая здоровые ткани человека. Далее проводится фотоактивация прибором FotoSan, вызывающая разрушение микробной стенки и гибель микроорганизмов.
Процесс абсолютно безопасен для здоровья, поскольку действие направлено исключительно на пораженные ткани. В этом особенность и уникальность метода FotoSan.